Это зависит от того, чем вы собираетесь заниматься. Если большую часть ваших расходов составляют товары и услуги, полученные с НДС (торговля), то выгоднее быть плательщиком. Если вы оказываете услуги и ваши расходы - это в основном зарплата работников (без НДС), то выгоднее быть неплательщиком. Надо также смотреть, кто ваши потенциальные клиенты. Если юридические лица (обычно плательщики НДС), то им все равно - ваш НДС они спишут в предналог. Если частные лица, то НДС увеличит для них стоимость услуг. И, конечно, у НДС-плательщиков сложнее учет и надо сдавать дополнительные отчеты.

Добавлю:

1. Если планируемый оборот будет явно выше 10 000 латов в год, то у Вас выбора не будет - как только превысите за кал. год, закон Вас обяжет регистрироваться плательщиком НДС.

2. Если Ваши клиенты юр. лица, то им будет гораздо выгоднее иметь с Вами дело, если Вы - плательщик НДС.