Конечно, не правильно.

И минимум, и льготы полагаются за те календ. дни, пока были трудовые отношения.

Может быть они уже "применились" при расчете отпускных?

в мае ое не работал только ходил в отпуск но начала отпуска с 13,04,07 по 10,05,07 в апрельской зарплате был полный необлагаемый минимум

Вам следует разобраться - не применялся ли необл. минимум к отпускным. Какое значение имеет работал или не работал?!

Отпускные деньги - это та же работа, только работать не надо. В том смысле, что сохраняются трудовые отношения, потому и мин. может быть и применен. Я ж не знаю, что у Вас за программа.

Смущает другое: почему в отношении компенсации не показываются соц. платежи?

т.к. начало отпуска было в апреле 13,04 то необлагаемый применялся в апреле в полном объёме 50 лат

Если мин. за май не применялся к отпускным, то

- ищите программиста, который знает, как работает Ваши программа;

- ищите того, кто работает с такой же программой.

Возможно, у вас мин. и льготы считаются по окончании месяца???

Или Вы не "нажимаете" нужную кнопку, которая сообщает программе о том, что больше Вы с этим работником "не работаете"?!