Если Вы SIA продаете партнеру в ES, но товар в ES не уходит от Вас, а в экспортной декларации ВЫ никаким боком, то У ВАС 21%. Это в стандартной ситуации.
Вы продаете на таможне ( а какой статус товара???) , склад в Риге, у условия DAT Цюрих. Кто груз отправляет в 3-ю страну?

Из того, что я поняла, если Вы оформляете экспорт, то 0%

Таможенный склад - это такая же территория, как и любое другое место этой же страны.Но, там может храниться ввезенный из 3-х стран и не выпущенный в свободное обращение товар.Если вы продаете его , то у вас 0% ПВН. Если нет, то определяемся дальше. Смотрим, что происходит с грузом - остается ли он на месте (в Латвии) или перевозится куда-то, причем вы принимаете в процессе настолько посильное участие, что имеете на руках документ транспортировки (ЦМР, коносамент и т.д.). Если остается в Латвии (даже с перевозкой), то применяете обычный ПВН. Если уезжает в 3-ю страну, то дополнительно необходимо оформить экспортную таможенную декларацию и у вас 0% по экспорту. Ну, а сделка в ЕС будет тогда, когда ваш груз уйдет в ЕС страну ее ПВН плательщику.

Mihno, Solik – большое спасибо за ответы, вы меня очень выручили

в итоге выяснилось, что товар будет ввезен на склад без применения IM4, соответственно получается, что товар на территорию Латвии/ЕС вообще не попадает, а последний в сделке вывозит его в 3-ю страну и мне дадут просто коносамент

Если товар будет ввезен на таможенный склад в Риге, (ИМ 4 тут ни при чем, потому как при выпуске товара в свободное обращение нет необходимости помещать тот товар на таможенный склад), то вполне возможно, что при продаже там вам придется показать продажу на таможенном складе.Что с тем товаром будет делать последний в сделке - не ваша забота.