Не знаю, как В ы сформулировали вопрос, но "этот случай" подробно расписан в законе. К тому же есть и разъяснения VID.
Например: https://www.vid.gov.lv/lv/ka-aprekinat-iedzivotaju-ienakuma-nodokli-ja-darbinieks-strada-vairakas-darba-vietas
Схема такая же.
676 правила оговаривают на 2018 год доход, выше которого не применяется диф.НМ - 12000.
Бухгалтер применяет 12000/12=1000.
Работник сам должен контролировать этот доход по всем своим "точкам". Когда увидит, что "дошёл до точки", идёт к своему бухгалтеру, где применяется PMNM, и пишет заявление о прекращении применения ему НМ зарплате.
Все приучаемся жить ответственно!

Bet varbūt izņem NG EDSā?

Ну, на apgadājamo льготы остаются.

Noslēdzām uzņēmuma līgumu ar fizisku personu,kas nav saimn.darbaveicējs, uz laiku.Vaiman viņš jāliek pie kopējā darba algu saraksta, vai kā?

Vai kā. 827.noteikumuspārlapojāt? Ir tur savas atšķirības, dažas loģiskas, dažas nu tā.