Если не ошибаюсь сейчас есть регула по 'этому поводу - работник сам выбирает в какой стране он будет налоги платить.

То есть он может приезжать сюда и работать, а оплату получать в Эстонии? Тогда как его принимать на работу? Без оплаты? Он реально приезжает раз в неделю в Ригу выписывает сам накладные, отгружает товар.

Но ведь по сути 'это его командировка - пусть они ему там командировку оформляют.

Э нет, по поводу директоров существуют отдельные нормы. Его з/п облагается всеми налогами в Латвии, причем неважно, кто ее платит, вы или эстонцы.

Пока ничего не поняла

А чего тут понимать, он обязан декларировать свои доходы в Латвии и платить подоходный налог

Ему за эту работу платят в Эстонии и отчисляют все налоги.Так какие доходы ему тут декларировать?

Как какие? Есть даже приложение к годовой декларации, называется "Доходы от нерезидента".

Он резидент Латвии и должен здесь платить налоги, сам заполнять декларацию и начислять налог.

Стоп.Он гражданин Эстонии.Получает з/п в центральном офисе Эстонии за руководство филила в Риге.

Если он гражданин Эстонии - это еще НЕ значит, что он НЕ резидент Латвии. Если он проживает в Латвии более 183 дней в году и имеет вид на жительство, то он резидент Лавии и налоги должен платить здесь. А если он нерезидент , то есть очень хорошие правила о начислении налога от доходов нерезидента - почитайте.

Он не проживает в Латвии более 183 дней в году и не имеет вида на жительство.

1) А филиал здесь зарегистрирован? В фин.инспекции на учете стоит?

2) Тогда читайте методические правила по удержанию ПНН с нерезидентов.

Распоряжение СГД 529 от 02.04.2004. часть 3

Пункт 11 Ar nodokli aplekās

2. Ienākums no algota darba, kas veikts LR tāda darba devēja labā, kurš nav Latvijas rezidents. Maksāšanas kārtība : deklarējot.

Почему Вы не хотите почитать нормативные документы на эту тему? Эта методика есть на сйте СГД.

Надеюсь я ответила на Ваш вопрос?