По поводу приминения 0% надо посмотреть закон об НДС статью о месте оказания услуги. Если попадаете под 0%, то, как я понимаю, в счете на услуги напишите ссылку на пункт закона, на основании которого применяется та или или иная ставка налога. Мне кажется, что у Вас может быть ст.7 ч.2

7.pants Nodokļa 0 procentu likmes piemērošana

2) pakalpojumiem, kas saistīti ar preču eksportu (arī tādu preču eksportu, kurām eksporta procedūra uzsākta citā Eiropas Savienības dalībvalstī), preču importu un tranzīta pārvadājumiem un pakalpojumiem brīvajā zonā un muitas noliktavā, kas tieši saistīti ar precēm, kuras ievestas Eiropas Savienības teritorijā no trešajām valstīm un trešajām teritorijām un nav izlaistas brīvam apgrozījumam (ieskaitot transporta, ekspedīcijas, preču uzglabāšanas, iekraušanas, izkraušanas, ekspertīzes un šķirošanas pakalpojumus);

http://www.vid.gov.lv/dokumenti/tiesibu_akti/likumi/par%20pievienotās%20vērtības%20nodokli_jauns.doc