оплата услуги

Подскажите, некая фирма оказывала нашей фирме услуги по договору (связано с электроникой и подготовкой некоего аппарата к работе и сдачей его зарубежным партнерам. По договору, они оказывали нам эти услуги 4 месяца а потом когда таки работа была сделана, система запущена и сдана в эксплуатацию - тогда они нам выставили счет и мы его оплатили. Но вот бухгалтер сказала что это неправильно и счет они должны были выставлять каждый месяц, соответственно оплата должна была идти каждый месяц? Это так? мы действительно нарушили правила?

Дело в том что каждый месяц - это сложно в связи со спецификой оказываемых услуг. Нам не надо было половинчатых услуг - нам надо было конкретно- запущен аппарат - получите деньги!

Подскажите как правильно?